由水电解制氢装置生产的氢气经缓冲罐后送至氢气纯化装置。

氢气首先经过脱氧塔，在催化剂的作用下，氢气中的氧气与氢气反应生成水。

反应式：2H₂+O₂          2H₂O。然后，氢气再经过氢气冷凝器（将气体冷却使气体中的水蒸汽冷凝生成水，冷凝水经集液器自动排放到系统外）进入吸附塔。

纯化装置流程示意说明：(详图见《系统流程图》)

  原料气                                                             产品气      

                                                           再生

纯化装置包括一个脱氧塔，三个吸附塔。其工作原理是：在脱氧塔中氢气和氧气在催化剂的作用下反应生成水。反应式：2H₂+O₂          2H₂O达到除氧的目的；在吸附塔中装有分子筛，由于分子筛对水、二氧化碳和其他杂质都有一定的吸附作用，从而达到去除水的目的。

再生的原理是用氢气将吸附塔分子筛的温度升至～200℃，使吸附的杂质解吸出来并被带出系统，分子筛解析出来的水首先经过冷却器将水蒸汽冷凝，冷凝水经集液器通过自动阀自动排放。